Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ino80Q6ZPV2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms