Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms