Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HjurpQ6PG16 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms