Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trak1Q6PD31 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trak1Q6PD31 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms