Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl2Q6PA06 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms