Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms