Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms