Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms