Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms