Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms