Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11bQ6DFW5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp11bQ6DFW5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms