Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms