Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fgd6Q69ZL1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms