Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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