Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp4fQ66X05 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4fQ66X05 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms