Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Top2bQ64511 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Top2bQ64511 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Top2bQ64511 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Top2bQ64511 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2bQ64511 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2bQ64511 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2bQ64511 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2bQ64511 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Top2bQ64511 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Top2bQ64511 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Top2bQ64511 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2bQ64511 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2bQ64511 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Top2bQ64511 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2bQ64511 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Top2bQ64511 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2bQ64511 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms