Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms