Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms