Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ift52Q62559 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift52Q62559 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms