Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms