Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Znf260Q62513 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf260Q62513 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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