Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn4Q62472 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms