Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sp4Q62445 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms