Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Hoxa13Q62424 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Hoxa13Q62424 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Hoxa13Q62424 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Hoxa13Q62424 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Hoxa13Q62424 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa13Q62424 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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