Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms