Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms