Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhocQ62159 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhocQ62159 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms