Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg2Q61878 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms