Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf12Q61286 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms