Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtcfQ61164 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtcfQ61164 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms