Protein–RNA interactions for Protein: Q61115

Ptch1, Protein patched homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch1Q61115 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptch1Q61115 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptch1Q61115 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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