Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wbp4Q61048 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wbp4Q61048 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms