Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrkQ60976 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JrkQ60976 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms