Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp4Q60972 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms