Protein–RNA interactions for Protein: Q60953

Pml, Protein PML, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmlQ60953 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmlQ60953 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmlQ60953 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmlQ60953 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmlQ60953 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms