Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms