Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms