Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irgm1Q60766 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irgm1Q60766 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms