Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SkiQ60698 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms