Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms