Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms