Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sin3aQ60520 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms