Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms