Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myh1Q5SX40 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myh1Q5SX40 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms