Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms