Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LpoQ5SW46 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms