Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ggnbp2Q5SV77 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ggnbp2Q5SV77 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp2Q5SV77 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms