Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms