Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms