Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms